Organizações indígenas de diferentes Estados declararam apoio ao indígena Sebastião Manchineri para presidência da FUNAI, ele foi indicado pelo DEM e PMDB do Acre. Sebastião é indígena da etnia Manchineri conhecido como "Sabá", presidiu a Coordenação das Organizações Indígenas da Amazônia (COIAB) entre 1994 e 1996. Por ser conhecido na atuação junto ao movimento indígena, sua indicação é aprovada por lideranças como Davi Kopenawa, Bemoro Metyktire, Paulino Paiakan, Marcos Apurinã, Tuira Kayapó, Aritana Yawalapiti e muitos outros nomes de destaque nacional ou históricos na luta pelo direitos indígenas. Um outro nome foi indicado pelo PMDB, o Noel Villas Boas filho do famoso sertanista Orlando Villas boas. Veja no link notas e cartas de algumas organizações sobre indicação para presidência da Funai.

Um dos principais apoiadores do general na campanha é um ativista conhecido por ser citado na mídia como investigado em 2013 pela Policia Federal suspeito de emitir falso Rani (Registro Administrativo de Nascimento de Índio), que é uma certidão indígena que possui função de identificar indígenas. Na maioria das universidades e concursos pelo sistema de cotas é o único documento aceito de comprovação de que uma pessoa é indígena. Preso em 2014 por causa de um processo de crimes de injúria e difamação movido por um jornalista, ele foi acusado de obstruir o trabalho da Justiça. Apenas liberado quando um advogado do partido que é filiado, o Psol, classificou a prisão como arbitrária e o juiz Carlos Zamith, da 8ª. Vara Criminal de Manaus, liberou sua soltura.

"Reafirmamos que essas organizações e articulações são legítimas representantes do movimento indígena e totalmente integradas a essa rede de articulação política do movimento, na luta pela defesa e promoção dos direitos aos povos indígenas, da qual a APOIANP também faz parte. Reafirmamos ainda que a APOIANP, juntamente com suas organizações membros e suas lideranças indígenas dessa nossa articulação do movimento indígena do Amapá e norte do Pará, são as únicas instâncias legalmente constituídas e autorizadas a falar em nome dos povos e organizações indígenas da nossa região, e qualquer outra pessoa que queira estar alinhada com essa nossa articulação tem que vir dialogar conosco antes de sair se dizendo representante de nossos povos e organizações. Diante disso vimos manifestar que somos veementemente contrários a militarização da Fundação Nacional do Índio (FUNAI) e a nomeação do General Franklimberg para a presidência do órgão indigenista estatal. Não aceitaremos que nossos Direitos sejam utilizados como barganhas ou manobras políticas por oportunistas de plantão.", trecho da nota da APOIANP divulgada no dia

A Associação Terra Indígena Xingu - ATIX, representação jurídica dos 15  povos indígenas do Território Indígena do Xingu no Estado de Mato Grosso também divulgou seu posicionamento contra indicação do general.

"Primeiramente, queremos declarar que somos contra a militarização da Funai e  não aceitamos qualquer indicação de nomes vindo do Partido Social Cristão – PSC por  entendermos que seus membros são orientados pelas doutrinas religiosas, militares e  além de serem protagonistas de atos públicos anti-indígenas. Respeitamos a indicação das lideranças indígenas que participam da discussão  em Brasília-DF, especialmente na indicação do indígena Sebastião Machineri. Portanto,  por se tratar de um ato administrativo do governo que afeta povos indígenas, chamamos atenção para a necessidade e importância de tornar a consulta aos povos indígenas ser  realizada em instancias e tempo adequados de modo a cumprir as determinações da OIT169 sobre consulta livre, prévia e informada." trecho da nota divulgada sobre indicação ao presidente da Funai.

O Conselho Indígena de Roraima – CIR, em nota também informou sua posição sobre o assunto: 

"A era da intervenção militar, da tutela, da dominação e tentativa de “pacificação” dos povos indígenas ficou no histórico do século passado. Hoje, vivemos a era do protagonismo, da autonomia, da democracia e do nosso fortalecimento e união, por isso, não aceitaremos as imposições de um governo ilegítimo e partidos (PMDB, DEM, PSC e outros) que querem nos tirar essas conquistas indicando sem consulta livre, prévia e informada, pessoas alheias ao cargo de espaços públicos, frutos de luta e conquista dos povos indígenas do Brasil (FUNAI, SESAI e outros). Não nos curvaremos e nem aceitaremos essa imposição, pois acreditamos na nossa força e luta coletiva dos povos indígenas do Brasil. Nesse sentido, reiteramos o posicionamento positivo da APIB em defesa dos direitos dos povos indígenas, nos manifestando também de que somos contrários à militarização da FUNAI e a intervenção do governo em nossos espaços de conquista. Precisamos, sim, de um órgão indigenista fortalecido e comprometido com as questões indígenas, exercendo a sua missão de forma participativa e comprometida.", trecho da nota do Conselho Indígena de Roraima em apoio à luta dos povos indígenas do Brasil." trecho de nota divulgada.

O protagonismo indígena ganha e conquista espaços na sociedade, cada vez mais cientes do seu direito não desejam ser vistos como tutelados ou pessoas incapazes de tomar decisões. A militarização da Funai é vista como uma ameaça ao órgão até mesmo pelo histórico já conhecido por meio da atuação do serviço de proteção ao índio (SPI) na ditadura militar relatadas no Relatório Figueiredo, algumas das maiores violações de direitos humanos contra aldeias e até extermínio de etnias.